李治在六年太子生涯中，先后成为四子二女的父亲，这些孩子出自四个母亲的腹中。而在这方面，太子妃王氏则很不走运，大概是出身实在太清高，她本人“性简重，不曲事上下”，根本不懂什么夫妇闺房之乐、逢迎帝王丈夫之道，也没有谁在这方面教育过她，因此她确实是不太得李治欢心的，多年也未曾生过孩子。这当然也足以从另一方面证明她并没有将妒忌写在脸上，因此李治才能与众多姬妾有这样不含糊的关系。在太子宫中最为得宠的女人，莫过于位份仅次于皇太子妃王氏的良娣萧氏。这其中萧良娣无疑是太子后宫中最得宠的女人，一连诞育了一子二女。
    然而，有道是“越多越不嫌多”，虽然身边有名份的妻妾成群，李治一面忙着“皇太子听政”，一面忙着应付家里的妻妾，（虽然家里的生活还做不完），却一面仍然常有务外之意。而他的外遇对象，正是父亲的侍姬才人武媚。
    一个是太宗的嫡亲儿子，一个是太宗的随身侍姬，李治和武媚之间应该早已互相认识。算起来，武媚入宫之时，李治只有十岁出头，尚在孩提之间，对父亲的妃嫔侍姬都不存在回避的问题，他们之间熟悉也很久了。这段姐弟恋是怎样开始的，只有当事人的他们才知道，我们永远无法想象其间过程。不过有一点应该是可以确定的，那就是对于李治和武媚来说，这段男女之情的开端，除了彼此间外貌性格的吸引和某种挑战似的刺激之外，共同的爱好和情趣也起了非常大的作用——比如他们都是大王书法的痴迷者。当然，彼此的身份也是这段情缘的另一种催化剂。背着无所不知的父亲与他的侍姬亲昵会是个什么光景什么心态？当然，有人也说过，李治童年丧母，可能有某种恋母倾向。但是换个角度来看，也很难想象李治当真象某些人描述的那样循规蹈矩，完全将父亲敬若神明。
    然而，无论后来的人对这段不伦之恋有怎样的猜测和议论，有一点还是可以确定的：不管是迷恋还是纯为找刺激，他们之间确实曾有情存在过，尽管这情缘一开始就颠覆了伦理，最后又搅乱了李唐天下的秩序。
    正史一般认为，李治与武媚的关系最终突破伦理底线，是在太宗生命的倒计时阶段。当时唐太宗抱病，李治以太子身份入侍，而武媚又是太宗的近身侍姬，两人之间有了更多使关系突飞猛进的机会，而他们也抓住了这个机会。
    ——说到这里，有两件事要单独拿出来议论一下：一道图谶和一道册后诏书。
    这道图谶的内容非常有名，说的是“唐三世之后，则女主武王代有天下”。据说当初唐太宗就是看到这道预言之后，才冷淡了武媚并将其斥为侍女的。更绝的是解释说让她当侍女是为了更好地找她的岔子以杀之避谶。这未免太小看中国皇帝的权威了：杀一个宫姬还需要公然找理由以便上堂公审吗？看见她都反感，还犯得着让她当贴身侍女，日日刺激大唐天子的神经、给她更多机会了解皇帝如何处理公事吗？——于是又有了另一种解释，说唐太宗不杀武媚，是怕万一杀了她，日后灾星更重。这个就更说不过去。因为在同样的传说中，唐太宗曾经因为疑心这道图谶将应验在小名“武娘”的武将李君羡的身上，而将李君羡杀之了事。怎么这时他就不怕灾星了？李世民自少年起就亲征疆场，甚至以亲身充当敢死队为乐，死在他手里的大人物乃至血亲数不胜数，杀死一名侍姬对他来说，又能有什么大不了的后果？
    而册后诏书则是若干年后李治封武媚为皇后时颁布的。在这道诏书里，李治这样描述自己做太子时的严谨：“朕昔在储贰，特荷先慈，常得侍从，弗离朝夕。宫壶之内，恒自饬躬；嫔嫱之间，未尝迕目。”，并说太宗对自己的操守非常赞叹，因此“圣情鉴悉，每垂赏叹，遂以武氏赐朕，事同政君，可立为皇后。”意思是说，李治做太子的时候朝夕不离太宗身边，谨慎到甚至从来不抬头看父亲的妃嫔，因此深得太宗欢心。为了表彰李治的品行，太宗便将身边的宫女武媚赐给了她。因此武媚之于唐高宗李治，就等于汉朝王政君之于汉元帝刘奭，是“父母赐，不敢辞”。而且身份高于其它女人，是做皇后的不二人选。
    ——然而，武媚真是太宗赐予李治的吗？当然不是。因为不看父亲的姬妾，所以父亲就奖给他一个女人？这是什么道理？就算是为了成全儿子的名声，当爹的也不可能这么干。何况做父亲的赐谁不行，非要选一个比儿子大四五岁的？李治做太子的时候早已娶妻纳妾儿女满堂，他又不是司马衷，要年长的女人教他为夫之道。
    推来算去，李治和武媚只能是自发的姐弟恋，除此之外别无它解。
    然而，当时武媚的现实身份是唐太宗的侍姬才人，因此，当太宗的去世之后，无论新任皇帝李治对她有多依恋，她都必须离开后宫（现在这个后宫是属于新皇帝的了），李治所能给她的最多也只不过是些诺言而已。
    事实上，登基前后的李治根本没有什么闲心去考虑情人武媚的去留问题。
    唐太宗李世民驾崩得多少有些不是地方，他是在行幸翠微宫时发病的，也就死在了这个远离长安城权力中枢的地方。二十一岁的太子李治面对这样可能瞬息万变的局面不知如何是好，只会搂着舅舅长孙无忌的脖子号哭不已。最后还是长孙无忌拿了主意，决定秘不发丧，而是让李治在第二天以太子的身份带着随行至翠微宫的飞骑、劲兵及旧将返回长安。经过一天的昼夜兼程，李治终于平安赶回了京城。随后，“舆驾”也摆着与皇帝活着时没有两样的仪仗，迅速地返回了长安。直到这时，长孙无忌才同时宣布太宗之死与李治登基。同时被宣布的，还有李治的嫡亲哥哥李泰不得奔丧进京的消息。